开放式告白

　　一名医生因一连串令人震惊的凶恶案而入监服刑，他忠心的妻子打算模仿同样的杀人手法作案，借以证明他的清白。

 以成为神奇宝贝大师为目标，小智（松本梨香 配音）、小刚（うえだゆうじ 配音）和小光（豊口めぐみ 配音）带着各自的神奇宝贝在世界各地进行艰苦的修业之旅，今天他们历经长途跋涉终于来到了风景秀美的米琪亚镇。在当地一对小兄妹的介绍下，小智一行前往神殿遗址游玩。谁知却遭遇了极其危险的情况。关键时刻，掌管时间的迪亚鲁加和守卫神殿的西娜（北乃きい 配音）、凯宾（岸祐二 配音）帮助了他们，能与神奇宝贝心灵沟通的西娜还熄灭了冥王龙的怒火。从西娜口中得知，创造了世界的神奇宝贝即将苏醒，它不仅会使时空扭曲错乱，还将为世界带来毁灭性的灾难…… 本片为神奇宝贝系列第十二部电影剧场版。

一奶同胞的兄弟洪达和洪宇同属于卡尼亚军方的秘密猎毒小队，在执行东南亚边境扫毒任务时，被狡猾的大毒枭贡泰偷袭，即将成为父亲的洪达为掩护弟弟洪宇牺牲，洪宇背负巨大的创痛回到家中，无法面对一对孤儿寡母，加盟新组建的独狼小队，重返边境为哥哥报仇。